Jeho činnosť je zameraná na komplexné riešenie problematiky získavania, spracovania, efektívneho využívania a ochrany zemských zdrojov s dôrazom na bezpečnosť technologických a pracovných procesov, environmentálnu zodpovednosť, ekonomickú efektívnosť a princípy udržateľného rozvoja. Ústav prepája tradičné oblasti baníctva, geotechnológií, banského plánovania a spracovania nerastných surovín s modernými prístupmi v oblasti bezpečnostného inžinierstva, požiarnej ochrany a záchranárstva, environmentálnych technológií, obehového hospodárstva, obnoviteľných zdrojov energie a udržateľnej energetiky, ekonomiky a manažmentu zemských zdrojov, geoturizmu a montánneho turizmu. Vďaka širokému odbornému zameraniu vytvára priestor na interdisciplinárnu spoluprácu a hľadanie inovatívnych riešení aktuálnych technologických, bezpečnostných, environmentálnych, energetických a ekonomických výziev.
V oblasti vzdelávania ústav zabezpečuje prípravu kvalifikovaných odborníkov v bakalárskom, inžinierskom a doktorandskom stupni vysokoškolského štúdia. Vzdelávací proces prepája teoretické poznatky s praktickými skúsenosťami, výsledkami vedeckého výskumu a aktuálnymi požiadavkami priemyselnej a hospodárskej praxe. Dôraz sa kladie na rozvoj odborných, technických, analytických a manažérskych kompetencií absolventov, ako aj ich schopnosti identifikovať, analyzovať a riešiť komplexné problémy v príslušných oblastiach odborného pôsobenia. V oblasti vedy a výskumu sa ústav sústreďuje na rozvoj nových poznatkov, výskum a aplikáciu progresívnych technológií a postupov. Výskumné aktivity reagujú na aktuálne výzvy v oblasti surovinovej a energetickej bezpečnosti, prevencie a riadenia rizík, ochrany životného prostredia, obehového hospodárstva, ekonomickej udržateľnosti a regionálneho rozvoja. Významnou súčasťou pôsobenia ústavu je spolupráca s domácimi a zahraničnými akademickými, vedecko-výskumnými a priemyselnými partnermi, zapájanie sa do národných a medzinárodných projektov, poskytovanie expertíznych a poradenských služieb a transfer výsledkov výskumu do hospodárskej a spoločenskej praxe.
Poslaním Ústavu zemských zdrojov je prostredníctvom kvalitného vzdelávania, vedeckého výskumu, inovácií a odbornej spolupráce prispievať k zodpovednému využívaniu prírodných zdrojov, zvyšovaniu bezpečnosti a efektívnosti priemyselných procesov, ochrane životného prostredia a posilňovaniu konkurencieschopnosti hospodárstva.
Odbornú, vzdelávaciu a vedecko-výskumnú činnosť ústavu zabezpečuje päť oddelení, ktorých vzájomne sa dopĺňajúce odborné zameranie vytvára predpoklady na komplexný a interdisciplinárny prístup k riešeniu súčasných výziev.